Amerika Serikat telah berada dalam kekacauan sejak munculnya D2s, spesies invasif yang berasal dari meteorit hitam yang jatuh ke Bumi. Sebuah keputusan publik melarang warga memainkan melodi apa pun, untuk mencegah korban lebih lanjut yang disebabkan oleh kebencian D2 terhadap musik — bahkan sekarang, di tahun 2047, larangan ini masih berlaku. Satu-satunya bentuk pertahanan umat manusia terhadap D2 adalah Musicarts, wanita muda yang mewakili karya musik klasik; dan Konduktor, yang mengendalikan mereka.
Takt Asahina, seorang ahli piano yang menyendiri, mendapati dirinya berubah menjadi Konduktor setelah serangan D2 spontan. Insiden yang sama membunuh adik perempuan Anna Schneider, Cosette, dan menghubungkan Takt dengan Musicart-nya, Destiny. Mencari cara untuk menstabilkan perjanjian di antara mereka sendiri, Takt dan Destiny—bersama Anna—memulai perjalanan berbahaya ke Markas Symphonica di New York City.
Takt sedang terburu-buru untuk mencapai kota sehingga dia bisa bermain piano lagi, meskipun hasratnya menarik makhluk yang dia benci. Sementara itu, rasa tanggung jawab Destiny menyeret kelompok itu ke dalam masalah di sepanjang jalan. Dengan jalur penuh D2 dan banyak lagi rintangan berat di depan mereka, akankah ketiganya berhasil mencapai New York City dalam keadaan utuh?
