Setelah berakhirnya Operasi Pemusnahan Keluarga Tsukiyama, anggota Komisi Pemberantasan Ghoul (CCG) telah tumbuh secara eksponensial dalam kekuasaan dan terus mengejar tujuan mereka untuk memusnahkan setiap hantu di Jepang. Setelah mengundurkan diri dari Quinx Squad, Haise Sasaki yang sekarang tampak tanpa emosi mulai mengambil lebih banyak tugas dari CCG tanpa memperhatikan kesulitannya. Terlepas dari ekspresinya yang hampa, ingatan Ken Kaneki muncul kembali di Haise, meninggalkannya dalam keadaan konflik internal. Sementara itu, perilaku barunya yang berhati dingin mempengaruhi orang-orang di sekitarnya. Pasukan Quinx dibiarkan berantakan, harus menghadapi kematian salah satu anggotanya tanpa dukungan dari mantan mentor mereka.
Di tengah kekacauan ini, baik Quinx Squad maupun Haise harus tetap menunaikan tugasnya di CCG, mau tidak mau. Namun, kehadiran kelompok misterius di belakang CCG telah diketahui Haise, dan bisikan korupsi tertentu juga tidak terdengar oleh Quinx Squad.
