Dalam masyarakat futuristik, Jepang telah menerapkan sistem kompleks yang disebut sebagai “Benang Merah Ilmu Pengetahuan” untuk mendorong pernikahan yang berhasil dan memerangi tingkat kelahiran yang semakin rendah. Berdasarkan perhitungan kecocokan, anak muda di usia 16 tahun ditetapkan sebagai pasangan nikah oleh pemerintah, dengan akibat yang berat menunggu mereka yang tidak mematuhi pengaturan tersebut. Bagi Yukari Nejima, seorang remaja yang menganggap dirinya rata-rata dalam segala hal, sistem ini mungkin merupakan cara terbaiknya untuk menjalani kehidupan yang memuaskan.
Namun, didorong oleh kegilaannya pada teman sekelasnya dan orang yang sudah lama dia sukai, Misaki Takasaki, Yukari menentang sistem dan menyatakan cintanya. Setelah beberapa keengganan awal, Misaki membalas perasaannya di saat-saat penuh gairah. Sayangnya, sebelum keduanya melanjutkan hubungan mereka, Yukari menerima pemberitahuan pernikahannya. Dia kemudian dilemparkan ke dalam jaring cinta dan kebohongan yang membingungkan ketika pasangannya yang kurang bersemangat, Ririna Sanada, menjadi terpesona dengan romansa terlarangnya.