Hitohito Tadano adalah anak laki-laki biasa yang memasuki hari pertamanya di sekolah menengah dengan rencana yang jelas: menghindari masalah dan melakukan yang terbaik untuk berbaur dengan orang lain. Sayangnya, dia langsung gagal saat duduk di samping madonna sekolah—Shouko Komi. Teman-temannya sekarang mengenalinya sebagai seseorang yang harus disingkirkan untuk mendapat kesempatan duduk di sebelah gadis tercantik di kelas.
Cantik dan anggun dengan rambut hitam panjang, Komi dipuja secara universal dan sangat populer meskipun kepribadiannya misterius. Namun, tanpa sepengetahuan semua orang, dia memiliki kecemasan yang melumpuhkan dan gangguan komunikasi yang mencegahnya bersosialisasi dengan sepenuh hati dengan teman sekelasnya.
Saat ditinggal sendirian di kelas, rangkaian peristiwa memaksa Komi berinteraksi dengan Tadano melalui tulisan di papan tulis, seolah-olah dalam percakapan satu arah. Menjadi orang pertama yang menyadari bahwa dia tidak dapat berkomunikasi dengan baik, Tadano mengambil kapur tulis dan mulai menulis juga. Dia akhirnya menemukan bahwa tujuan Komi adalah mendapatkan seratus teman selama dia di sekolah menengah. Untuk tujuan ini, dia memutuskan untuk membantunya, dengan demikian juga menjadi teman pertamanya.